Panti Asuhan Yatim Putri Khairunnisa adalah organisasi sosial keagamaan yang lahir ditengah-tengah masyarakat bangsa Indonesia. Kiprahnya sangat positif dan dinamis dibidang sosial keagamaan dalam rangka mencapai cita-cita mengangkat harkat kaum dhuafa agar dapat meningkatkan taraf hidupnya, maju berkembang, selaras dengan warga masyarakat dalam memenuhi kebutuhan hidup normal.

Cita-cita tersebut dilandasi niat luhur dan atas dorongan serta motivasi dalam mengamalkan surat Al Maun dan berdasarkan UUD 1945 pasal 34 ayat 1 yang berbunyi fakir miskin dan anak-anak terlantar dipelihara oleh negara. Bertolak dari dorongan dan motivasi tersebut diatas serta harapan masyarakat khususnya keluarga alumni anak asuh panti asuhan Yatim Putra Islam Yogyakarta yang menghendaki agar menambah santunan untuk anak asuh putri.

Dari sinilah tepatnya tanggal 6 juli 2009 panti asuhan putra islam menerima anak asuh putri dan menjelma dengan diberi nama Panti Asuhan Yatim Putri Khairunnisa yang beralamat di Kuton, Tegaltirto, Berbah, Sleman Yogyakarta.